Il est possible de choisir plusieurs projets et définir un ordre de priorité pour le ou les projets à privilégier.  voir tutorial .

Pour chacun des graphiques apparait votre score actuel c'est à dire le Total Credit, votre nom d'utilisateur avec toutes les mini teams ou vous êtes inscrit [AF>EST>...>...] Nom , ainsi que votre appartenance à  l'Alliance Francophone ( si celui-ci n'apparait pas c'est que vous n'êtes pas inscrit à l'AF voir ici )

 

 

 

 

 

L'écran de veille de Rosetta montre le progès de chaque trajectoire au moment ou elles se produisent.
On distingue 4 fenêtres différentes montrant la forme de la chaîne de protéine.

"Searching" ( recherche) : elle montre les différents mouvement que Rosetta effectue pour obtenir un résultat.
On peut voir la forme de la chaîne en suivant les couleurs de l'arc-en-ciel du bleu au rouge.
"Accepted" : le dernier résultat retenu.
"Low Energy" (basse énergie) : La trajectoire courante qui a nécessité le minimum d'énergie.
"Native" : La vraie forme expérimentale si elle est dejà connue.

 

On observe aussi 2 autres graphiques montrant l'énergie et le RMSD des mouvements acceptés :

"Accepted Energy" : graphique qui montre montre l'énergie des mouvements nécessaires pour chaque trajectoire ( en abscisses les progrès dans la trajectoire, en ordonée l'énergie).

 "RMSD" (root mean square deviation) : On fait souvent appel au RMSD pour analyser l'évolution de la structure globale d'une protéine. Dans ce cas on calcule l'écart quadratique moyen entre la structure obtenue au cours de la simulation et la structure de départ (structure cristallographique).

Le RMSD prend donc en compte la distance scalaire entre atomes du même type appartenant à deux structures disctinctes après les avoir préalablement superposées. Le but est de minimiser cette valeur. (GRAPHIQUE : en abscisse, le RMSD , en ordonnée: les progrès de la trajectoire)

 

Le dernier graphique (nuage de point en bas à droite) trace l'énergie et le RMSD de chaque mouvement retenu. On retrouve ce même graphique sur la page des meilleures prédictions.

(explications complètes en anglais sur le site de Rosetta -Et traduction complète de la page sur le site BoincFrance )

 

 

 

 

 

 

 

Sans doute le plus bel écran de veille de tous les projets BOINC avec de nombreuses fonctionnalités. Cependant cette quasi perfection a un prix: les calculs de Boinc se font 40 % moins rapidement avec l'écran de veille par rapport à BOINC sans l'écran de veille. Votre ordinateur ne donne alors pas la totalité de sa puissance. Mais c'est à vous de décider certains l'enlèvent d'autres le gardent pour admirer les changements de temps en fonction des jours

Sur les captures d'écran ci dessous c'est l'année 1810 qui est analysée, les premières unités que vous analyserez seront entre 1800 et 1850. Puis petit à petit en fonction de l'ancienneté et du nombre d'unités renvoyées ils deviendront beaucoup plus intéressantes.

Juste un petit bémol, les unités de Climate sont très longues il faut au minimum plusieurs centaines d'heures de calcul pour finir une unité de travail ( contre seulement quelques heures pour les autres projets.

Ce projet est donc à utiliser que si vous disposez d'un Processseur très puissant ainsi qu'au moins 512Mo de Ram qui permettront de calculer les unités dans des délais convenables. Il a en outre été constaté un nombre relativement élevé de plantage d'unité avant leur fin, ce qui peut souvent être démoralisant. Pour éviter les plantages il faut se connecter sur son compte climate  , appuyer sur l'option "View or edit general preferences" puis "Edit preferences" et  de cocher yes à coté de "Leave applications in memory while preempted?"

 

 

 

 

 

A - tourner la terre dans le sens des aiguilles d'une montre
B - lumière "frontale" ('headlight') = éclairage de face
D - arrête la rotation de la terre
H - menu d'aide des principales touches ( en anglais )
M - Bascule des unités SI (mètre, °C) en unités anglo-sax. (inch, °F)

P - Affiche les précipitations
R - Pressions atmosphériques

S - Carte des nuages, mode "net"

T - Températures au sol
U - carte des nuages, mode "flou"
X - carte nue, avec reliefs
Z - tourner la terre dans le sens inverse des aiguilles d'une montre
 

Zoom maximum pour les effets suivants :
 C - affiche/masque les noms des pays
V - affiche/masque les noms des capitales
I - affiche/masque les surfaces des pays
L - affiche/masque les longitutes/latitudes des capitales
W: Affiche une carte "à plat" au lieu d'un globe.
K: Affiche/efface les frontières.

Numéros sur le clavier classique (pas le clavier numérique)
0 - bascule étoiles d'arrière-plan
1 - liste des participants du projet
2 - mode "filtre" pour les cartes de précipitations, pressions, et temp.
3 - carte des états, mode 'fil de fer', rouge
4 - carte favorite de Carl : le mode "étoile noire" (cf. Star Wars)
7 - carte des états, mode 'fil de fer', vert

8: Affiche le nombre de TS restant avant le prochain checkpoint.
9: Augmente/réduit la résolution des cellules.

 

 

 

 

 

 

 

Bouton droit + souris : Zoom avant/ Zoom arrière.

 

 

 

(même écran de veille pour seti Beta test)

 

Il existe plusieurs programmes pour analyser les résultat trouvés par seti BOINC:
seti home-Log9x
BoincLogX
Seti Map View v6.31

 

 

 

 

 

 

 

 

L'écran de veille d'Einstein est composé d'une sphère en rotation représentant la voûte céleste et ses constellations.

Apparaissent aussi sur cette sphère les pulsars connus ainsi que les restes de supernovas déjà répertoriées.

En rouge ce sont les restes de supernovas connus. Ces supernovas se trouvent en grand nombre au centre de notre galaxie.

En violets ce sont des pulsars connus qui ont été découverts de façon électromagnétique. Ils se situent surtout dans la voie lactée et dans le centre de notre galaxie

 

Les possibilités d'interactions avec la carte du ciel :
(seulement en mode avec la fenêtre windows, c'est à dire en appuyant sur "Montrer le Graphique dans le client Boinc)

Ctrl + bouton gauche de la souris : faire tourner la sphère
Ctrl + bouton droit de la souris : zoom arrière / zoom avant

Touches non encore disponibles mais à venir, bien qu'on attends depuis longtemps maintenant.
Ctrl + Page Haut : augmenter la vitesse de rotation.
Ctrl + Page Bas : réduire la vitesse de rotation.
Ctrl + Flèche : rotation de la sphère dans la direction choisie
Ctrl + S : afficher/cacher les étoiles
Ctrl + C : afficher/cacher les constellations .
Ctrl + P : afficher/cacher les étoiles de neutrons (pulsars).
Ctrl + N : afficher/cacher les restes de supernovas.
Ctrl + T : afficher/cacher l'affichage horaire de temps de base GMT.
Ctrl + 0 : réinitialiser le graphique.
Ctrl + L : afficher/cacher les observatoires
Ctrl + B : afficher/cacher la bannière (tout ce qui est statique dans le graphique)

 

Sur la première capture d'image les constellations apparaisent à l'envers puisqu'on observe l'univers visible depuis l'extérieur.

Pour voir le ciel tel qu'on le voit toutes les nuits, il faut faire un zoom maximum de tel sorte qu'on observe le ciel depuis l'intérieur de la sphère.

 

 

Cette cible indique la partie du ciel qui est actuellement étudiée. On retrouve aussi les coordonnées de la partie de l'espace étudié par Einstein dans la partie inférieur droite de l'écran de veille ( RA (ascension droite) : 19.55 et DEC (déclinaison): -45.31 ).

 

 

Les marqueurs en forme de L représentent la position des instruments qui collectent les données analysées par Einstein ce sont de très grands interféromètres de Michelson . Leurs orientations sont exactes, sauf qu'ils ne sont pas représentés à l'échelle.

 

LIGO Hanford Observatory (LHO), Hanford, Washington, USA, (N 46.45°, W 119.41°), composé de deux interféromètres, l'un avec des bras de 4km de long (H1) et l'autre avec des bras de 2km de long (H2).

GEO600, Hannovre, Allemagne (N 52.24°, E 9.81°), un interféromètre avec des bras de 600m de long.

LIGO Livingston Observatory (LLO), Livingston, Louisiane, USA, (N 30.56°, W 90.77°) il est composé d'un interféromètre avec des bras de 4km de long (L1).

 

 

 

 

 

 

 

Avec LHC on a un écran de veille qui représente les particules en mouvement dans l'accélérateur de particule du CERN.

On voit aussi en bas l'avancé de l'unité de travail

Tourner : Appuyer avec le bouton gauche de la souris en faisant bouger la souris.

Zoom avant et arrière: Appuyer sur le bouton droit de la souris en faisant bouger la souris de haut en bas

En appuyant sur H onle menu de toutes les autres touches possibles:

Touches 1,2,3,4 du pavé analogique: changer la période de temps

t : changer la couleur de l'écran de veille

espace Mettre l'écran de veille en plein écran

ctrl+r : restaurer les préférences par défaut

a : augmenter le nombre de particule (plus il y aura de particule sur l'écran de veille et plus LHC mettra longtemps à effectuer une unité)

r : supprimer des particules

c : enlever toutes les particules en mouvement.

F3 : Pilote Automatique

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Fenètre A: Dockings en temps réel (current docking)
Dans le Manager Boinc, cliquez sur l'onglet Tâches, sélectionner une des unités en cours de traitement, puis appuyer sur le bouton "Montrer les graphiques". Ou tout simplement atteindre que l'ordinateur se mette en veille si vous avez sélectionné l'écran de veille par défaut. Vous verrez alors apparaitre une fenêtre graphique semblable à celle-ci :

A quoi correspondent les flèches noires, la structure en hélice et la structure en boucle ?
Le feuillet bêta correspond à un schéma simplifié des protéines qui permet aux scientifiques une lecture et une compréhension plus facile de la forme de cette protéine. Le « squelette » tridimensionnel de la protéase du VIH-1 est retranscrit sur l'écran sous la forme d'un feuillet noire et est grossis environ 10.000.000 fois.
Dans cette fenêtre, vous pouvez voir en trois dimensions la forme des différentes séquences d'acides aminés de la protéase du VIH-1. Pour plus de clarté, nous ne montrons pas les détails de tous les atomes de la molécule de protéine, juste l'épine dorsale. Se rappeler, que toutes les protéines, y compris la protéase du VIH-1, se composent de chaines d'acides aminés, liées comme des perles sur une ficelle. Il y a vingt types d'acides aminés naturelles, et vous pouvez les imaginer comme différentes sortes de briques. Certaines parties de ces chaines d'acides aminés s'attachent entre eux tout en repoussant d'autres parties. Les différentes parties de la chaîne d'acides aminés de la protéine se groupent ensemble en masse compacte dans des formes tridimensionnelles caractéristiques.

A quoi correspondent les sphères colorées dans la fenêtre A ?

L'algorithme de recherche utilisé par AutoDock n'est pas qu'une simple représentation d'une solution possible pour une molécule médicament candidat (ligand) mais évalue aussi immédiatement beaucoup de solutions possibles. Les sphères montrent les endroits pour lesquels la meilleure molécule médicamenteuse a été calculé par un dockings de la protéase du VIH-1, les différentes couleurs montrent leur niveau de cohérence.

AutoDock essaye de trouver la meilleure manière pour laquelle le ligand actuel, celui que votre agent a téléchargé, peut s'adapter à la protéase cible du VIH-1. Vous pouvez vous représenter la chose par l'analogie suivante : le médicament idéal que nous essayons de trouver serait une « clef, » et la protéase du VIH-1, une « serrure». Cependant à la différence des clefs dans la réalité, beaucoup de molécules médicamenteuse se plient pour se déformer. À cet égard, les molécules ressemble au corps d'un danseur ; le même corps peut adopter un nombre élevé de poses et de formes différentes. Malheureusement, nous ne pouvons pas savoir quelle forme le médicament candidat adoptera sans avoir testé préalablement des millions de possibilités différentes pour choisir la meilleure.

Pour trouver le meilleur ajustement, nous employons un algorithme. Un algorithme est juste une recette, une liste d'ingrédients et d'instructions sur la façon dont on doit faire ou ne pas faire quelque chose. Dans notre algorithme de recherche, nous appliquons réellement les principes de l'évolution pour trouver la meilleure manière dont notre molécule-médicament candidat s'adapterait à la la cible, la protéase du VIH-1. Comme pour l'évolution dans le monde réel, nous avons une « population » de solutions possibles pour résoudre le problème.

C'est ce ce qui vous voyez quand vous regardez les différentes sphères colorées à proximité des flèches noires (le feuillet). Les couleurs correspondent aux croix de même couleur dans la fenêtre B. Celles qui représentent les énergies les plus négatives sont considérés comme les meilleurs dockings. AutoDock emploie une représentation pour chacun de ces dockings de ligand qui indique l'endroit où est situé le centre des ligands, son orientation, et sous quelle forme elle est actuellement adoptée. AutoDock applique des opérations génétiques pour représenter des paires aléatoires en fonction de la forme du ligand pour ensuite produire deux nouvelles représentations et par conséquent de meilleures solutions potentielles. Vous pouvez voir ce que calcule AutoDock en regardant le graphique dans la fenêtre C.

 

Fenêtre B: Energie nécessaire au Docking (amarrage)

Nous voyons ici l'énergie minimale pour chacun des amarrages de ligand candidats issus de la population actuelle des solutions possibles. L'énergie d'un ligand qui se lie à la protéase du VIH-1 se décompose en 2 types d'énergies différentes: l'énergie électrostatique et l' énergie non liée. L'énergie électrostatique mesure de quel façon les charges pairs et impair font interagir le ligand et la protéase. L'énergie non liée mesure l'attraction non-électrostatique entre les deux.